Die Politik San Bernardos wird von der Organización Comercial Oceánica de San Bernardo (O.C.O.) gelenkt, einer in Bahía de Flores sitzenden Handelsgesellschaft, die 1826 aus der früheren Kaiserlich-Oceanischen Compagnie hervorgegangen ist.

An der Spitze der O.C.O. und damit des bernardischen Staatswesens, des Estado de San Bernardo, steht das Generaldirektorium, welches sich aus dem Generaldirektor und zwei weiteren Direktoren zusammensetzt. Es entspricht der Regierung und z.T. dem Parlament anderer Staaten und wird von den Gesellschaftern der O.C.O. auf der Generalversammlung jeweils für drei Monate gewählt. Traditionell teilen sich die beiden Direktoren die Innen- und Außenpolitik, während der Generaldirektor für die allgemeine Vertretung nach innen wie nach außen zuständig ist.

Die ständigen Vertreter der O.C.O. bei auswärtigen Staaten oder Unternehmen nennt man Embajador del Estado (Botschafter des Staates). Sie werden vom Generaldirektorium einvernehmlich ernannt und entlassen.

Intern gliedert sich San Bernardo in die neun Comunidades (Gemeinschaften) Bahía de Flores, San Sebastián, Ciudad del Sur, Mataram, Rabaul, Rotorua, Samotoa, Taranaki und Wanaga.